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Cet effet est utilisé en microscopie pour confiner la lumière d’excitation sur une fine épaisseur au-dessus du substrat : la microscopie à réflexion interne totale (TIRF ou Total Internal Reflection Fluorescence) permet d’imager les fluorophores à l’interface, tout en s’affranchissant de la fluorescence hors focus provenant de l’épaisseur de l’échantillon. Cela améliore grandement le contraste des images et peut être appliqué à l’imagerie membranaire ou à la localisation de molécules uniques qui intervient dans les méthodes de super-résolution PALM (PhotoActivated Localization Microscopy) ou STORM (Stochastic Optical Reconstruction Microscopy) .
Des microscopes permettant une excitation TIRF sont disponibles sur les plateformes :
Microcell (IAB)
PIC (GIN)
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